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一株猪捷申病毒全基因组序列测定及分析
- 黎少国1,张建峰2,张春红2,沈海燕2,刘志成2*
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2017, 42(5):
35-37.
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摘要
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计量指标
根据 GenBank 已发表的猪捷申病毒(porcine teschovirus,PTV)13 种血清型全基因组序列,分 析其保守区域并设计 10 对特异性引物。从临床腹泻病料中提取核酸,经 RT-PCR 扩增目的片段 , 分别对这些片 段进行克隆、序列测定、拼接,最终获得一株猪捷申病毒全基因组序列,命名为 PT-GD。主要结构蛋白 VP1 进化 分析表明,该毒株与 PTV12 型 CC25、YZ119 的 VP1 核苷酸序列同源性分别为 80.1 % 和 79.7 %,与其他血清型毒 株进化距离相对较远,表明该毒株为猪捷申病毒血清型 12 型。该病毒全基因序列的测定及血清型鉴定为进一步 深入研究猪捷申病毒在我国的遗传变异及其生物学特性提供了依据。